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運送会社の電子帳簿保存法・インボイス対応|届く請求書の受け取りと保存のしかた

燃料・高速・修理・協力会社など、運送会社に届く請求書を、電子帳簿保存法とインボイス制度に沿って受け取り・保存する方法。検索できる保存の要件と、登録番号の確認のしかた。

法令2026/11/14 公開迅(JIN)運送経営システム 編集部(株式会社ニシキ運送)
この記事の要点
  • メールやWebで受け取った請求書は、紙に印刷せず電子のまま保存する(2024年1月から)
  • 「日付・金額・取引先」で探せる形で保存する
  • インボイスは登録番号と税率ごとの金額・税額が載っているかを、受け取る時に確かめる

この記事は2026年11月時点の要点です。会社の規模による例外や、具体的な保存のしかたは、国税庁の資料や税理士にご確認ください。

運送会社に届く請求書は種類が多い

運送会社には、燃料カード・高速道路(ETC)・整備工場・タイヤ・保険・協力会社など、毎月たくさんの請求書が届きます。届き方も、郵送・メールのPDF・Webからのダウンロードとばらばらです。電子帳簿保存法とインボイス制度は、この「受け取った請求書」の扱いに大きく関わります。

電子帳簿保存法:受け取った電子の請求書は電子のまま保存

2024年1月から、メールやWebなど電子で受け取った請求書(電子取引のデータ)は、紙に印刷して保存するのではなく、電子のまま保存することが必要になりました。

要件中身
改ざんされないタイムスタンプを付ける、訂正・削除の記録が残る仕組みで保存する、または訂正・削除の決まりを社内で定めて守る、など
探せる取引の日付・金額・取引先で検索できること(日付や金額は範囲で探せること)
見られるパソコンの画面や印刷で、すぐに中身を見られること

売上が一定以下の会社など、検索の要件がゆるくなる例外もあります。紙で届いた請求書は、これまでどおり紙で保存することもできます(スキャンして電子で保存する方法もあります)。

インボイス制度:受け取る時に確かめること

2023年10月から、仕入れにかかった消費税を差し引く(仕入税額控除)には、原則として適格請求書(インボイス)の保存が必要です。受け取る時に、次の項目が載っているかを確かめます。

  • 発行した会社の名前と登録番号(Tから始まる番号)
  • 取引の日付
  • 取引の内容
  • 税率ごとに分けた金額の合計と、適用した税率
  • 税率ごとの消費税額
  • 受け取る側(自社)の名前

協力会社の中には、免税事業者で登録番号を持たない会社もあります。その場合の控除の扱いは経過措置で時期により変わるので、税理士と確かめてください。

実務の流れ(例)

  1. メール・Web・郵送(スキャン)で届いた請求書を1か所に集める
  2. 日付・金額・取引先・登録番号を読み取って、請求書に付ける
  3. 登録番号と税率の記載を確かめ、足りない所は相手に連絡する
  4. 自社の記録(給油・高速・整備・配車)と照らす
  5. 電子のまま、日付・金額・取引先で探せる形で保存する

よくある質問

メールで届いた請求書を印刷して保存するのはだめですか?
2024年1月からは、電子で受け取った請求書は電子のまま保存する必要があります。印刷した紙だけを保存するのは、原則として認められません(例外の扱いは税理士にご確認ください)。
検索できる形とは、専用のシステムが必要ですか?
必ずしも必要ではありません。ファイル名に日付・金額・取引先を入れてフォルダで管理する方法などもあります。ただ、件数が多い運送会社では、読み取って自動で付ける仕組みの方が漏れがありません。

迅(JIN)でやる場合

運送会社が自社のために作ったシステム

迅(JIN)では、届いた請求書を迅AIが読み取り、日付・金額・相手を付けて、すぐ探せる形で残します。取り込む時に登録番号と税率を確かめ、燃料・高速・修理は車ごとの原価にも仕分けます。

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迅AIが進める。
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